东北西门塔尔牛：就国内西门塔尔牛总体质量来说，东北地区为最好。至于基因，国外四大系别的西门塔尔牛的基因都有。东北西门塔尔牛体型好，花片均匀，红白花多于黄白花。

内蒙西门塔尔牛：以前多用俄系西门塔尔牛与草原牛进行杂交而来，当然现在也是各个系别的西门塔尔牛都有，不过仍然比较偏向于俄系西门塔尔牛。黄白花居多，杂牛比较多。总体质量不如东北西门塔尔牛，但内蒙牛胜在抗病能力强，几乎不会生病。

南方西门塔尔牛：南方西门塔尔牛质量较北方西门牛要差很多，就算代别达到了长势也不行，主要因为母本不行。南方大多数地区本地牛个体都较小，经过多代杂交仍然会保留一定基因影响牛的长势。图中为四川西门塔尔牛（蜀宣花牛），虽然外表看着纯度较高，但体型较北方西门塔尔牛仍要小许多。并且南方地区用西门塔尔牛改良时间短，多数牛代别也达不到高代。

其他地区西门塔尔牛：山东、山西、河南、陕西等地也有自己独特特色的西门塔尔牛，不过由于近年来养牛数量的下降，以及从东北、内蒙地区不断进牛，现在基本以被东北、内蒙西门塔尔牛同化。